192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3916 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  97.65 
 
 
255 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  71.65 
 
 
259 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  61.72 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  61.63 
 
 
258 aa  298  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  60.24 
 
 
254 aa  296  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  62.65 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  57.98 
 
 
256 aa  276  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  60 
 
 
259 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  54.86 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  52.81 
 
 
267 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  53.31 
 
 
257 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  50.69 
 
 
221 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  47.58 
 
 
241 aa  201  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  51.55 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  51.55 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  46.3 
 
 
281 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  47.77 
 
 
282 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  40.23 
 
 
319 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  42.25 
 
 
283 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  44.29 
 
 
246 aa  175  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  35.69 
 
 
241 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  35.69 
 
 
241 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  43.44 
 
 
220 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  42.4 
 
 
220 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  39.27 
 
 
227 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  39.63 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  39.27 
 
 
225 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  38.89 
 
 
238 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  36.87 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  37.27 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  38.57 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.62 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  33.64 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  33.64 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  33.64 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  35.94 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  35.27 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  35.27 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  34.1 
 
 
221 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  35.27 
 
 
221 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  34.1 
 
 
222 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  34.1 
 
 
222 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  36.92 
 
 
220 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  34.1 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  34.1 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  34.1 
 
 
222 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  33.18 
 
 
221 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  35.35 
 
 
219 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 
227 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  33.64 
 
 
227 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  33.18 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  32.72 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 
226 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  34.51 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  32.89 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  35.59 
 
 
223 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  33.77 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 
227 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  34.68 
 
 
223 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  33.62 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  35.45 
 
 
227 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  33.79 
 
 
250 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 
227 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 
227 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  31.51 
 
 
243 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  33.64 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  36.87 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  32.86 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  33.64 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  32.88 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  32.88 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  35.05 
 
 
223 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  34.23 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  32.69 
 
 
279 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  32.42 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  32.13 
 
 
221 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  32.73 
 
 
274 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  33.2 
 
 
256 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  32.23 
 
 
256 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>