166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4080 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  52.75 
 
 		 281 aa  231  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  56.82 
 
 		 246 aa  228  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  52.29 
 
 		 254 aa  227  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  50.92 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  50.69 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  50.23 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  50.69 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  49.77 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  51.38 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  49.77 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  50 
 
 		 256 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  47 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  47.66 
 
 		 257 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  43.58 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  46.01 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  43.58 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  46.54 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  48.15 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  41.59 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  44.86 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  45.62 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  45.62 
 
 		 258 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  38.28 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  38.89 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  37.96 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  37.56 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  33.18 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  35.45 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  34.1 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  31.8 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  31.8 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  32.26 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  32.26 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  31.8 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  30.14 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  30.88 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  31.19 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  32.11 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.65 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  30.41 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  30.88 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  30.41 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.77 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  28.64 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  29.03 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  31.19 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  30.28 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  30.81 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  30.23 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  30.7 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  30.49 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  31.08 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  29.77 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  29.22 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  30.39 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  30.87 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  30.41 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  29.57 
 
 		 263 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  30 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.38 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  31.82 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  32.42 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  29.09 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  28.57 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  26.67 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  29.19 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  29.91 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  28.11 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>