170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2480 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  100 
 
 		 227 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  91.63 
 
 		 227 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  82.74 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  82.74 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  82.74 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  364  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  83.19 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  82.1 
 
 		 229 aa  357  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  83.41 
 
 		 227 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  79.91 
 
 		 227 aa  353  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  81.06 
 
 		 225 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  82.86 
 
 		 227 aa  343  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  68.04 
 
 		 227 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  61.75 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  60.91 
 
 		 221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  59.82 
 
 		 221 aa  267  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  59.82 
 
 		 221 aa  267  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  59.36 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  59.17 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  57.8 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  58.26 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  57.8 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  57.8 
 
 		 222 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  57.8 
 
 		 222 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  57.34 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  63.68 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  59.17 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  56.11 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  57.01 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  56.74 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  55 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  51.14 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  49.31 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  47.47 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  48.17 
 
 		 219 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  46.12 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  46.08 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  46.41 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  47.83 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  38.53 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  41.18 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  40.61 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  39.17 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.07 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  31.84 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  31.39 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  34.86 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.39 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  31.34 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  31.53 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  30.52 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  30.09 
 
 		 319 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  33.48 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  29.49 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  32.26 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.18 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  29.35 
 
 		 283 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  30.26 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  29.68 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  31.48 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.22 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  28.83 
 
 		 259 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  30.91 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.85 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  29.22 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  29.22 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  31.34 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  30.48 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  29.02 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.11 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  28.7 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  26.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  28.44 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  30.41 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  25.65 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  24.77 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  27.57 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  26.98 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  25.57 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>