187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5100 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
259 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  63.71 
 
 
259 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  58.02 
 
 
254 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  58.02 
 
 
254 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  60.38 
 
 
255 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  62.74 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  60 
 
 
255 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  57.79 
 
 
256 aa  274  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  56.11 
 
 
258 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  57.31 
 
 
257 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  55.68 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  54.65 
 
 
267 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  53.1 
 
 
241 aa  223  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  51.38 
 
 
221 aa  222  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  52.31 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  52.31 
 
 
258 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  48.47 
 
 
281 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  52.21 
 
 
282 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  41.51 
 
 
319 aa  185  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  47.73 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  41.53 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  37.56 
 
 
225 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  34.55 
 
 
241 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  34.55 
 
 
241 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 
220 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  40.37 
 
 
220 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  37.73 
 
 
222 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.53 
 
 
221 aa  138  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  36.94 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  36.04 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  37.21 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  41.47 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  33.95 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  36.28 
 
 
221 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  36.28 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  36.28 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  35.81 
 
 
221 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  35.81 
 
 
221 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.6 
 
 
238 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  35.6 
 
 
372 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  32.57 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  31.19 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  33.03 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  31.19 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  31.65 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  32.91 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  31.19 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  33.49 
 
 
220 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  34.8 
 
 
226 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  32.73 
 
 
223 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  32.43 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  34.86 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  32.43 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  30.73 
 
 
221 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  34.24 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  30.28 
 
 
221 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  32.43 
 
 
222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  30.28 
 
 
222 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  32.43 
 
 
222 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  30.28 
 
 
221 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  33.63 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  32.43 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  30.91 
 
 
227 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  30.73 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  32.62 
 
 
288 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  30.57 
 
 
227 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  31.9 
 
 
227 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  34.17 
 
 
268 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  31.11 
 
 
220 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  31.47 
 
 
227 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  31.19 
 
 
227 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  30.13 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  30.13 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  30.13 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 
229 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  30.18 
 
 
227 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  33.47 
 
 
260 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  30.73 
 
 
222 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 
268 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  29.37 
 
 
297 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  31.54 
 
 
274 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>