180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0216 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
222 aa  428  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  45.98 
 
 
283 aa  188  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  40.45 
 
 
259 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  41.18 
 
 
254 aa  148  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  38.64 
 
 
254 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  38.74 
 
 
220 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  37.73 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  40.94 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  35.45 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  37.39 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  38.46 
 
 
220 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  36.82 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.39 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  37.27 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  37.73 
 
 
259 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  38.12 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  37.73 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  38.64 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  35.32 
 
 
241 aa  125  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  37.73 
 
 
256 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  31.74 
 
 
319 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  36.82 
 
 
257 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  37.23 
 
 
237 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  37.73 
 
 
257 aa  121  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  35.27 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  34.98 
 
 
220 aa  118  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  39.55 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  34.09 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  34.08 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  39.09 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  33.64 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  33.63 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  32.29 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  32.73 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  34.55 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  31.98 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.34 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  33.18 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  31.55 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  34.53 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  33.63 
 
 
222 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  33.63 
 
 
222 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  33.94 
 
 
223 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  33.63 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  33.63 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  32.27 
 
 
221 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  32.27 
 
 
221 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 
256 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  31.36 
 
 
227 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  33.63 
 
 
222 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  32.72 
 
 
268 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 
227 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  30.32 
 
 
246 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  34.39 
 
 
223 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  33.04 
 
 
221 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  34.45 
 
 
221 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
220 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.36 
 
 
225 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 
281 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  31.72 
 
 
227 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.22 
 
 
256 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  31.53 
 
 
263 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
220 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  31.51 
 
 
219 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  29.28 
 
 
223 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  31.98 
 
 
221 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  31.98 
 
 
221 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  31.98 
 
 
221 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 
274 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  33.64 
 
 
252 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  31.4 
 
 
219 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  29.09 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  29.55 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  31.16 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.73 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  33.49 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  32.87 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>