156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3004 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  78.8 
 
 		 227 aa  336  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  67.74 
 
 		 227 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  66.97 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  66.82 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  68.93 
 
 		 227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  62.67 
 
 		 221 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  64.06 
 
 		 227 aa  279  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  64.68 
 
 		 227 aa  278  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  64.68 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  63.51 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  64.68 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  64.68 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  64.68 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  64.22 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  63.76 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  63.76 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  62.84 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  63.33 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  54.59 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  53.21 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  53.21 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  53.42 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  53.21 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  50.68 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  52.29 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  52.29 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  50.23 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  50.23 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  51.14 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  50.23 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  50.23 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  52.49 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  49.77 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  48.67 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  53.21 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  55.05 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  51.38 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  51.38 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  50.68 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  53.42 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  47.93 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  49.08 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  45.54 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  46.63 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  45.67 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  37.39 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  37.79 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  37.44 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  36.99 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  37.1 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  34.23 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  33.78 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.19 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  35.51 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  33.64 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  33.78 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  32.72 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  32.72 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  30.41 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  32.13 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  35.32 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.03 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  32.16 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  31.19 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.28 
 
 		 267 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  25.99 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  34.38 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  31.65 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  31.65 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  29.68 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.31 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  31.05 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  31.05 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  26.96 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  26.67 
 
 		 319 aa  85.5  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  28.05 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.67 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  25.57 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  27.59 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  27.52 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  28.64 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  26.55 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  26.55 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  28.38 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>