187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3317 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
222 aa  430  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  56.36 
 
 
224 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  46.88 
 
 
250 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  46.88 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  46.88 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  46.43 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  46.43 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  46.43 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  36.49 
 
 
258 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  35.94 
 
 
255 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  36.87 
 
 
255 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  32.57 
 
 
254 aa  114  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  35.48 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.19 
 
 
254 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0842  phage shock protein A, PspA  31.98 
 
 
219 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1034  PspA/IM30 family protein  32.43 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.510528  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  37.79 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  35.86 
 
 
256 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  38.36 
 
 
256 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  39.17 
 
 
267 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  33.64 
 
 
256 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.96 
 
 
221 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  34.03 
 
 
250 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  34.42 
 
 
217 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  34.91 
 
 
268 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 
220 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 
263 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  30.88 
 
 
221 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  33.51 
 
 
283 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  30.88 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  30.88 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  34.76 
 
 
240 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  34.86 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  30.8 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  33.61 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  39.17 
 
 
258 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  32.58 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  32.58 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  32.78 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  32.72 
 
 
241 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  28.83 
 
 
281 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  39.63 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  32.41 
 
 
238 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  32.62 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  32.6 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 
295 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  34.22 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  31.82 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.02 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  34.44 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  32.11 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  32.11 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  29.86 
 
 
227 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  29.82 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  31.05 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  28.64 
 
 
246 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.56 
 
 
282 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  31.88 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.64 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  34.1 
 
 
257 aa  84.7  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  30.77 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  30.09 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  30 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  30.26 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  31.42 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  28.32 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  28.32 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  28.32 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  28.76 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  28.32 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  31.53 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  33.04 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  31.74 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  29.52 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  31.67 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  30.18 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  28.44 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  30.22 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  28.05 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>