189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0487 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  45.98 
 
 		 222 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  42.25 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  41.09 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  40.23 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  42.62 
 
 		 256 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  41.63 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  39.69 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  41.07 
 
 		 220 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  37.74 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  41.53 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  39.74 
 
 		 241 aa  153  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  39.75 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  39.82 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  38.28 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  39.46 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  38.31 
 
 		 246 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  39.68 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  37.78 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  33.77 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  36.59 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  37.93 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  38.67 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  39.47 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  38.05 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  39.66 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  41.78 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  41.49 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  40.35 
 
 		 220 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  40.52 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  36.1 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 237 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  33.75 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  32.81 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  32.1 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  33.92 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  40.96 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  40.96 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  40.96 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  33.17 
 
 		 223 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  40.43 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  32.74 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  32.76 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  35.33 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  35.52 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  31.78 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  30.98 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  32.33 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  32.84 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  32.33 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  32.33 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  32.33 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.07 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  31.71 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  37.44 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  32.29 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  30.98 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.78 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  32.07 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  32.07 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  36.02 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  31.92 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  29.35 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  31.34 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  33.15 
 
 		 221 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  33.87 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  31.39 
 
 		 222 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  31.39 
 
 		 222 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  32.19 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  33.04 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  31.39 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  31.39 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  32.75 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  32.09 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  30.04 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  30.04 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  30.98 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  31.39 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  31.15 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  31.52 
 
 		 227 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  31.52 
 
 		 227 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  31.52 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  32.14 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  30.11 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  32.97 
 
 		 220 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  30.36 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  30.58 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  31.71 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>