188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  38.18 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  39.27 
 
 		 256 aa  141  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  37.78 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  35.91 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  36.36 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  37.04 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  34.39 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  35.62 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  35.62 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  35.45 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  36.53 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  36.07 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  36.53 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  35.27 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  35.62 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  33.79 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  35.16 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  35 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  35 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  35 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  34.7 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  34.53 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  34.53 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  34.98 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  34.53 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  34.53 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  34.91 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  36.04 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  35.78 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  35.14 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  35.87 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  35.68 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  35.16 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  33.79 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  35.59 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  35.59 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  35.59 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  34.09 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  35.14 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  35.14 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  34.91 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  32.27 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  36.61 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  34.05 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  31.96 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  28.77 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  31.63 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  34.98 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  32.41 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  31.82 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  29.69 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  31.63 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  31.34 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  36.07 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  31.63 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  35.09 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  31.16 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  31.16 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  34.3 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  31.16 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  32.97 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  33.18 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  36.53 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  31.96 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  30.88 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.79 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  30 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  32.59 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  33.33 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  32.27 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  33.04 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  31.94 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  30.74 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  32.62 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  31.19 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>