161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0896 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 220 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  94.55 
 
 		 220 aa  390  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  69.72 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  58.45 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  43.12 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  39.47 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  33.49 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  33.94 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  34.39 
 
 		 258 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  32.73 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  32.24 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.82 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  32.59 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  32.26 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  34.1 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  33.18 
 
 		 256 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  31.8 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.45 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  34.6 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  32.27 
 
 		 282 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.71 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.18 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  32.72 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  34.55 
 
 		 267 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  30.14 
 
 		 246 aa  99  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  32.43 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  32.56 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  31.78 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  32.26 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  31.8 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  31.65 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  29.68 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  33.8 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  29.28 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  29.68 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  31.82 
 
 		 257 aa  92  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  29.82 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  30.88 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  27.65 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  27.65 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  32.17 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  31.91 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  30.87 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  29.22 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  32.27 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  30.18 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.8 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  27.6 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  27.6 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  30.09 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  27.6 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  30.35 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  28.44 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.88 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.95 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  32.27 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  31.43 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  34.38 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  30.27 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  29.91 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.17 
 
 		 281 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  32.05 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  26.48 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  27.85 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  28.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.68 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  30.41 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.19 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  31.55 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  30.9 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  33.81 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>