175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0333 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2519  PspA/IM30 family protein  32.13 
 
 
226 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.167742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2081  PspA/IM30 family protein  32.13 
 
 
226 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2413  PspA/IM30 family protein  32.13 
 
 
226 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.685259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1936  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
226 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1863  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
226 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00208754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1498  PspA/IM30 family protein  31.67 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1998  PspA/IM30 family protein  31.67 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3312  PspA/IM30 family protein  31.67 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0293434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2371  PspA/IM30 family protein  31.67 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1270  PspA/IM30 family protein  31.67 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1320  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133998 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6130  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
226 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1949  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
226 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1973  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
226 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  0.0785415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  33.93 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  30.63 
 
 
220 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  31.84 
 
 
220 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.25 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  29.28 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  31.42 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  27.8 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 
255 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  29.13 
 
 
319 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.8 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  30.36 
 
 
256 aa  85.1  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  26.24 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  30.18 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  25.34 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  29.65 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.41 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  30.63 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  30.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  28.16 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  29.6 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  29.6 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.15 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  29.6 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  29.6 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.87 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.96 
 
 
257 aa  78.2  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  26.41 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  29.15 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  29.15 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  29.15 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  29.15 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.22 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  29.15 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  24.77 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  27.15 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  29.35 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 
288 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  25.23 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  28.05 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  28.25 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  24.66 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  28.15 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  26.99 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  25.33 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  25.86 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  23.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.34 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  25.23 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  25.98 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  24.43 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  26.49 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  25.56 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  25.64 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  26.48 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  26.75 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  25.88 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  27.11 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  24.36 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  22.94 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  25.68 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  25.68 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  23.87 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  31.18 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  27.62 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.15 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  27.19 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  24.86 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  21.46 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  24.32 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  24.86 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  24.78 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>