120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2519 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1498  PspA/IM30 family protein  99.56 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2519  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.167742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2081  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1998  PspA/IM30 family protein  99.56 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3312  PspA/IM30 family protein  99.56 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0293434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2371  PspA/IM30 family protein  99.56 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2413  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.685259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1270  PspA/IM30 family protein  99.56 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  92.92 
 
 		 226 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  88.05 
 
 		 226 aa  387  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  88.05 
 
 		 226 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1863  phage shock protein A, PspA  92.48 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00208754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6130  phage shock protein A, PspA  92.48 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1936  phage shock protein A, PspA  92.04 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1949  phage shock protein A, PspA  92.48 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1973  phage shock protein A, PspA  92.48 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  0.0785415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1320  phage shock protein A, PspA  91.59 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  85.84 
 
 		 226 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  32.13 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  29.86 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  28.51 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  28.76 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  29.66 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.23 
 
 		 319 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.22 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  28.07 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  25.89 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.14 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  28.33 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  28.51 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  24.55 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  27.51 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  27.63 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  28.7 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  28.26 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  26.46 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  24.66 
 
 		 283 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  27.68 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  24.43 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  26.46 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  24.44 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.23 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  23.89 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  25.32 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  25.32 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  24.11 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  24.68 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  25 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  24 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  24 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  24.68 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  28.57 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  23.89 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  25.32 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  23.11 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  26.58 
 
 		 274 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  23.53 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  26.11 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  24.19 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  24.89 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.41 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  30.65 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  23.11 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  26.16 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  23.39 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  26 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  25.86 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  24.47 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.58 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  24.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3175  phage shock protein A, PspA  23.48 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  22.84 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  23.76 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  23.63 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  27.08 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  26.14 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  27.91 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  23.48 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  22.94 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  22.48 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  23.11 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  24.11 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  20.35 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>