80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3175 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3175  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  29.8 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  28.63 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  27.85 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  28.63 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  28.63 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  26.07 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.47 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  26.58 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  27 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  28.19 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  29.26 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.07 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  30.43 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  27.95 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  28.82 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.02 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.26 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  28.63 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  27.47 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  23.31 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  23.28 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  25.43 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  25.61 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  25.86 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  24.87 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  25.76 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  25.37 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  25.32 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  24.68 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  28.03 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  24.68 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  22.17 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  24.26 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  22.17 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  25.86 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.9 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  29.41 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  22.28 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  24.45 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  23.71 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  24.67 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  26.81 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  24.36 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  24.24 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  23.39 
 
 		 372 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  29.41 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  23.12 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  23.37 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  24.62 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  25.31 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  25.25 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  26.27 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  26.51 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  25.33 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  25.62 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  26.56 
 
 		 232 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  26.63 
 
 		 219 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  24.47 
 
 		 243 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  23.18 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>