152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1204 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1034  PspA/IM30 family protein  42.08 
 
 		 222 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.510528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0842  phage shock protein A, PspA  43.12 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  36.76 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  35.68 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  35.68 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  35.14 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  34.42 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  35.68 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  33.51 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.34 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  34.62 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  29.91 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  30.37 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  32.45 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  31.38 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  32.71 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  28.7 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1345  PspA/IM30 family protein  29.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1319  PspA/IM30 family protein  29.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1318  PspA/IM30 family protein  29.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1454  PspA/IM30 family protein  29.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000577339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1528  PspA/IM30 family protein  29.41 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70975e-31 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1598  PspA/IM30 family protein  28.88 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000566906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1560  PspA/IM30 family protein  28.88 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000688756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1492  PspA/IM30 family protein  27.07 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00023246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3852  PspA/IM30 family protein  27.07 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740704  hitchhiker  0.00000000000675972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1360  phage shock protein A, PspA  28.49 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.95 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.52 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1157  phage shock protein A, PspA  25.57 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  28.9 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  28.9 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1313  phage shock protein A, PspA  29.73 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  28.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  28.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  32.43 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  27.57 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  27.1 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  26.7 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.71 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  26.7 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  27.57 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  27.1 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  32.43 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.81 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.02 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  25.7 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  31.89 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  28.18 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.47 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  32.29 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  27.15 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  26.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  24.74 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  28.43 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.86 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  22.94 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  27.42 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  24.89 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  28.57 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  24.23 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  26.64 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  30.29 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  25.7 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  30.45 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  25.71 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  24.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  26.44 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  24.74 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  27.98 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  29.12 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  26.09 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  23.47 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  27.94 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  24.23 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  24.23 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  24.23 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>