190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3520 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
224 aa  440  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  56.36 
 
 
222 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  48.61 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  48.61 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  49.07 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  48.61 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  48.61 
 
 
250 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  41.18 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  38.71 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  36.82 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  37.09 
 
 
254 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  39.44 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  38.03 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  41.47 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  37.44 
 
 
283 aa  118  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  37.56 
 
 
255 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  31.82 
 
 
221 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  40.85 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  35.56 
 
 
217 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1034  PspA/IM30 family protein  34.05 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.510528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  32.73 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  38.29 
 
 
257 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  31.34 
 
 
225 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  34.39 
 
 
241 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0842  phage shock protein A, PspA  33.51 
 
 
219 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  35.05 
 
 
246 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  34.27 
 
 
281 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  37.84 
 
 
258 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  36.2 
 
 
238 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  33.64 
 
 
220 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  37.39 
 
 
258 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.68 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  36.49 
 
 
267 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  34.68 
 
 
220 aa  99  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
220 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.62 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  31.14 
 
 
297 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  34.98 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  32.74 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  32.03 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  31.56 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  32.46 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  36.49 
 
 
257 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  33.82 
 
 
263 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  34.15 
 
 
237 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  29.68 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  29.68 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  31.11 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  30.8 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  34.69 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  33.02 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  32.6 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  33.94 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3852  PspA/IM30 family protein  30.54 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740704  hitchhiker  0.00000000000675972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  34.05 
 
 
288 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1345  PspA/IM30 family protein  31.82 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1319  PspA/IM30 family protein  31.82 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1318  PspA/IM30 family protein  31.82 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1454  PspA/IM30 family protein  31.82 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000577339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1528  PspA/IM30 family protein  31.82 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70975e-31 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  33.04 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  31.53 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1492  PspA/IM30 family protein  31.25 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00023246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1598  PspA/IM30 family protein  31.25 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000566906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1157  phage shock protein A, PspA  29.67 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1560  PspA/IM30 family protein  31.25 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000688756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  32.3 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  30.08 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  28.25 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1360  phage shock protein A, PspA  31.25 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  29.58 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  32.06 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  31.19 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  31.67 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  28.25 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  30.32 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  32.09 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  28.97 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  28.97 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  28.97 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.56 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  29.39 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  33.17 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  31.65 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  30.04 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  30.88 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  33.53 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  31.25 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  30.49 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  30.77 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  28.63 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  30.41 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  30.39 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>