163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1807 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  100 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  97.8 
 
 		 227 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  97.8 
 
 		 227 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  97.36 
 
 		 227 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  96.04 
 
 		 227 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  96.04 
 
 		 227 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  96.04 
 
 		 227 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  95.59 
 
 		 227 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  95.59 
 
 		 227 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  85.84 
 
 		 225 aa  370  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  83.63 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  87.56 
 
 		 227 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  83.84 
 
 		 229 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  82.22 
 
 		 227 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  85.78 
 
 		 227 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  83.81 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  69.86 
 
 		 227 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  62.27 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  60.37 
 
 		 221 aa  264  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  58.9 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  58.9 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  58.9 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  60.09 
 
 		 221 aa  257  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  57.34 
 
 		 222 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  64.77 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  57.34 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  57.34 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  56.42 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  55.96 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  59.63 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  55.96 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  53.85 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  54.42 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  52.73 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  53.85 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  51.6 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  49.31 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  49.31 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  52.91 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  47.47 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  52.25 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  46.12 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  48.06 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  41.18 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  41.23 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  39.17 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  39.37 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.14 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  34.55 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  34.5 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  32.29 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  31.65 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  32.13 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  30.09 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  30.43 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  31.53 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  32.19 
 
 		 283 aa  98.2  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  30.13 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  31.05 
 
 		 257 aa  95.9  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  33.18 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.77 
 
 		 267 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  32.42 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.47 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  32 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.14 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  30.73 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  30.73 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.28 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  28.51 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  27.43 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  27.4 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  29.22 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.14 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  27.8 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  26.78 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  28.12 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.04 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  38.46 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>