156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0607 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
279 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  77.89 
 
 
295 aa  437  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  69.42 
 
 
272 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  69.17 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  63.45 
 
 
288 aa  332  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  55.84 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  50.64 
 
 
250 aa  235  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  48.96 
 
 
263 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  49.14 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  50.66 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  49.36 
 
 
233 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  48.09 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  48.37 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  50.21 
 
 
263 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  48.95 
 
 
260 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  44.84 
 
 
254 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  43.62 
 
 
268 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  43.2 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  47.16 
 
 
272 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  43.75 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  43.8 
 
 
247 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  42.86 
 
 
251 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  40.42 
 
 
372 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  40.43 
 
 
244 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  40.43 
 
 
244 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  32.69 
 
 
255 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  31.84 
 
 
256 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.69 
 
 
255 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  29.06 
 
 
254 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  32.91 
 
 
259 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.25 
 
 
259 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  31.3 
 
 
258 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.43 
 
 
254 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  31.12 
 
 
241 aa  99.8  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  34.19 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  31.97 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  32.07 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  32.47 
 
 
220 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  34.19 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  30.86 
 
 
319 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.65 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  32.2 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  33.45 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  32.42 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  27.35 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  27.43 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  29.18 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  27.39 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  27.39 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  27.39 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.35 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  30.18 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  32.6 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  29.57 
 
 
221 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  28.03 
 
 
237 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  29.91 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  27.43 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  26.69 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.86 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.41 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  27.16 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.41 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  26.41 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  25.65 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  25.83 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  25.65 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  25.65 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  27.76 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  27.47 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  28.33 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  27.04 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  27.04 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.39 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  27.9 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  27.05 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  27.83 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  27.23 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  30.89 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  28.94 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>