100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2534 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  79.22 
 
 		 251 aa  362  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  67.36 
 
 		 268 aa  321  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  66.53 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  66.12 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  69.87 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  64.73 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  64.54 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  66.67 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  62.5 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  55.46 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  53.04 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  55.33 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  51.48 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  51.97 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  51.3 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  44.84 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  46.41 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  44.8 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  46.12 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  41.43 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  45.73 
 
 		 372 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  45.26 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  38.55 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  38.55 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  30.35 
 
 		 256 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  32.41 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.13 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.8 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.95 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  29.15 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  26.72 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  30.65 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.16 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  28.74 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  32.73 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  27.39 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  30.65 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  27.39 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  27.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  27.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  27.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  27.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  27.39 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.28 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  26.96 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  26.96 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.11 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  28.39 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.19 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.88 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  29.61 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  26.38 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  21.25 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  23.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  27.59 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.49 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  26.22 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.18 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  23.5 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  24.88 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  25.12 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  22.08 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  23.85 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  22.65 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  22.08 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  22.08 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  22.08 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  24.58 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  23.5 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  23.5 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  23.55 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  21.67 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  29.58 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  23.14 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  23.33 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  21.4 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  23.33 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  23.04 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  20.43 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  27.59 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  24.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  24.09 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  22.13 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  28.04 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  22.98 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  22.08 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  23.66 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  26.14 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  28.97 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  25.34 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  25.34 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  23.18 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  25.44 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  22.27 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>