133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2017 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  39.26 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  39.92 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  41.87 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  40.52 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  41.25 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  40.34 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  40.43 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  39.66 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  39.75 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  37.93 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  41.91 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  40.52 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  39.83 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  41.53 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  39.43 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  38.55 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  41.05 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  39.3 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  39.3 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  36.73 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  35.92 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  34.33 
 
 		 372 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  28.57 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  28.02 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.4 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  25.86 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  27.05 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  27.39 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  27.47 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  29.35 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  28.14 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  26.18 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  26.58 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  27.35 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  27.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  28.04 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  24.14 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.35 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  27.72 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.16 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  26.92 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  26.92 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  27.72 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  24.57 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  26.92 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.02 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  25.77 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  24.79 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  27.85 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  26.63 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  27.39 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  27 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  26.63 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  26.09 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  27.17 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  25.43 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  25.1 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  26.84 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  26.8 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  30.23 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  30.23 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  26.84 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  27.8 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  30.23 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  30.23 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  28.68 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  28.68 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  33.68 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  31.53 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  31.53 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  30.83 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  28.68 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  28.02 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  28.68 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  31.73 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  35.35 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  31.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.66 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  31.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>