137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0952 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  81.22 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  76.73 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  76.33 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  75.42 
 
 		 263 aa  341  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  71.49 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  73.25 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  64.54 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  66.67 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  59.75 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  58.13 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  52.77 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  54.94 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  51.9 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  53.07 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  50.43 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  47.97 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  44.96 
 
 		 295 aa  204  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  43.28 
 
 		 297 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  44.49 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  39.47 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  44.64 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  40.77 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  41.13 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  41.13 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.85 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.42 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.58 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  30.99 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  28.57 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  28.29 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.28 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  33.05 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  32.77 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  32.77 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.87 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  26.81 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  32.22 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  26.94 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  26.96 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  30.08 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  30.96 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  34.36 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.53 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  26.32 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.46 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  27.2 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  27.17 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  23.25 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  25.97 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.36 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  26.44 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  24.89 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  27.08 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  25.5 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  27.39 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  25.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  25.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  21.49 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  24.56 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  24.89 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  24.89 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  25.64 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  25.5 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  22.87 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  29.5 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  27.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  27.34 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  28.63 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  29.63 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  22.03 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  26.9 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  21.82 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  28.06 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  27.67 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  28.16 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  27.67 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  23.6 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  25.93 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  23.23 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  25.16 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  28.06 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  28.06 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  27.34 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  25.66 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  30.3 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  22.37 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  30.85 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  24.31 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  22.78 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>