132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3220 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  100 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  74.57 
 
 		 232 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  65.22 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  56.07 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  56.65 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  53.09 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  52.46 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  51.43 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  52.77 
 
 		 260 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  51.23 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  53.04 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  55.36 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  50.64 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  49.79 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  48.37 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  54.15 
 
 		 272 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  50.66 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  47.72 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  44.08 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  49.58 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  48.55 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  42.26 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  41.99 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  39.92 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  39.92 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  31.6 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  30.67 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  30.38 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  31.69 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  29.74 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.06 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  28.03 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.47 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  31.66 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  28.39 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.83 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  25.44 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  27.07 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  26.64 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  28.46 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  27.13 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  27.13 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.88 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  24.47 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  24.47 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  24.47 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  27.71 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  27.6 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  33.19 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  24.27 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  23.53 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  31.37 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  30.59 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  27.83 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  27.13 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  26.58 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  26 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  27.07 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  23.24 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.98 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  32.88 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  25.57 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  27.35 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.33 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  28.19 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  23.81 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  23.95 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.28 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  27.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  27.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  24.58 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  25.97 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  23.83 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.88 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.11 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  23.38 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  28.07 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  26.6 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  23.33 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  26.74 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  22.44 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  27.49 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  25.7 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  24.57 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>