107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1280 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  81.68 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  79.49 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  77.41 
 
 		 260 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  75 
 
 		 246 aa  348  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  78.02 
 
 		 263 aa  337  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  71.19 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  65.48 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  69.71 
 
 		 269 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  61.42 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  52.44 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  57.26 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  55.46 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  51.71 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  52.79 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  51.53 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  43.62 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  47.66 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  42.06 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  42.13 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  42.15 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  41 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  40.52 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  40.52 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  40.52 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.48 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  33.58 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  30.59 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  28.16 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.8 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  29.44 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  27.27 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.73 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  28.14 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  31.6 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.57 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.86 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  28.63 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  31.09 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.65 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  33.8 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.83 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  24.79 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  29.5 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  31.49 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  29.5 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  26.61 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  30.67 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.5 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.99 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.96 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  27.47 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  31.65 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.27 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  27.47 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  26.18 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  27.54 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  24.78 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  30.52 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  25.13 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  26.86 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  25.13 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  26.18 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  25.85 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.5 
 
 		 220 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  34.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  27.71 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  23.63 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  27.71 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  24.77 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  28.1 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  25.53 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  28.76 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  28.76 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  22.31 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  28.89 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  23.31 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  30.23 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  24.53 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  28.1 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  28.89 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  23.79 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  22.54 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  27.27 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  27.45 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>