18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3139 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2465  phage shock protein A, PspA  86.02 
 
 		 236 aa  390  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000493409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5084  phage shock protein A, PspA  58.08 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  23.04 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.49 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  31.86 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  22.71 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  23.31 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.76 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  25.23 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  24.1 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0025  phage shock protein A, PspA  21.76 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  20.98 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  22.27 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  19.68 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  23.95 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>