16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2465 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2465  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 236 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000493409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  86.02 
 
 		 236 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5084  phage shock protein A, PspA  58.72 
 
 		 231 aa  261  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  24.14 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.61 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  28.48 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  29.27 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  21.52 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  23.96 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  26.87 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0025  phage shock protein A, PspA  23.42 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  23.25 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  26.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  22.81 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  28.06 
 
 		 226 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  22.84 
 
 		 225 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>