17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5084 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5084  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  58.26 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2465  phage shock protein A, PspA  58.6 
 
 		 236 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000493409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  24.04 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  23.56 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  21.95 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  22.18 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  26.11 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  23.9 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  21.84 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  22.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2408  phage shock protein A, PspA  23.25 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0025  phage shock protein A, PspA  22.22 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  23.97 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  24.17 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  23.35 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  24.04 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>