31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1778 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 272 aa  533  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  80.95 
 
 		 275 aa  407  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  78.91 
 
 		 272 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  75.74 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  75.74 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  75.74 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  81.59 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  74.36 
 
 		 270 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  76.15 
 
 		 280 aa  363  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  73.05 
 
 		 288 aa  360  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  67.21 
 
 		 284 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  67.16 
 
 		 277 aa  334  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  64.89 
 
 		 291 aa  331  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  65.12 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  72.27 
 
 		 274 aa  328  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  53.14 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  51.61 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  48.09 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.73 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  53.45 
 
 		 85 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  48.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  50.91 
 
 		 98 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  52.73 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  23.55 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  45.16 
 
 		 106 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  39.68 
 
 		 113 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  43.64 
 
 		 115 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  22.81 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  26.42 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>