30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1358 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  91.75 
 
 		 290 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  66.32 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  70.4 
 
 		 272 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  70.85 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  70.85 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  70.85 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  69.96 
 
 		 272 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  69.14 
 
 		 270 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  72.8 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  67.92 
 
 		 288 aa  335  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  68.05 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  65.78 
 
 		 275 aa  331  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  68.07 
 
 		 272 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  63.89 
 
 		 277 aa  311  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  53.36 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  52.46 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  50.64 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  48.21 
 
 		 98 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  48.28 
 
 		 81 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.55 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0090  phage shock protein A, PspA  27.09 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  38.16 
 
 		 106 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>