33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3927 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  69.96 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  68.53 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  70.59 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  70.59 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  70.59 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  70.17 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  69.75 
 
 		 272 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  66.53 
 
 		 284 aa  323  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  64.58 
 
 		 275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  68.65 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  70.17 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  71.85 
 
 		 272 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  63.89 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  63.89 
 
 		 290 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  51.25 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  53.78 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  49.36 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  26.05 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  46.88 
 
 		 98 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  52.73 
 
 		 81 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  52.73 
 
 		 85 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  22.27 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  22.75 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  46.55 
 
 		 106 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  44.64 
 
 		 115 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2465  phage shock protein A, PspA  21.55 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000493409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3139  phage shock protein A, PspA  23.11 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  24.22 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>