30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1400 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  91.75 
 
 
291 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  64.66 
 
 
284 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  70.78 
 
 
272 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  70.78 
 
 
272 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  70.78 
 
 
272 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  70.37 
 
 
272 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  69.14 
 
 
272 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  73.03 
 
 
274 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  67.97 
 
 
270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  66.25 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  66.39 
 
 
280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  64.53 
 
 
275 aa  322  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  61.8 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  67.65 
 
 
272 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  53.36 
 
 
248 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  51.23 
 
 
279 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  50.64 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  46.43 
 
 
98 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  48.28 
 
 
81 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  49.15 
 
 
91 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0090  phage shock protein A, PspA  28.16 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.9 
 
 
256 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  49.09 
 
 
60 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  49.09 
 
 
60 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  26.99 
 
 
256 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  40.28 
 
 
106 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>