173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1822 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  100 
 
 		 237 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  98.31 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  32.55 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  30.04 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  30.48 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  31.9 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  27.84 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  30 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  29.52 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  33.92 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  33.48 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  33.48 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  31.48 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  24.7 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.63 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  27.49 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  32.16 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  25.3 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  27.95 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  30.52 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  28.7 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.7 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.44 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  31.02 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  28.64 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  26.87 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  27.4 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  27.91 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  30.56 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  27.14 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  25.87 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  28.85 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  25.71 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.1 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  29.44 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  29.44 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  28.49 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  28.1 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  28.1 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  28.1 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  28.1 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  25.21 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  27.4 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  25.21 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1034  PspA/IM30 family protein  29.02 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.510528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  27.4 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  27.45 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  27.4 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  27.4 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  35.16 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  29.15 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  27.4 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  25.23 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  28.31 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  28.04 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  26.06 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  26.67 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  27.53 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  27.8 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0842  phage shock protein A, PspA  27.42 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  27.63 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  28.32 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.17 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  25.37 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  29.15 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  26.56 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  26.36 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  26.5 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  28.32 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  24.66 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  25.79 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  30.05 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  28.05 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  27.04 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  26.92 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>