174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0996 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  53.49 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  50.7 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  42.34 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  39.01 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  37.17 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  33.03 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  36.28 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  38.57 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  34.08 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  36.94 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  41.11 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  38.46 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  37.23 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  38.57 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  39.09 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  36.57 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  38.64 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  35.71 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  35.2 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.05 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  31.88 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  31.88 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  33.48 
 
 		 246 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  32.42 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  34.42 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  39.06 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  33.19 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  38.54 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  30.63 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  31.36 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  33.19 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  34.25 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  33.78 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  32.88 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  30 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  30 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  30 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  28.7 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  30.14 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  30.14 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  29.86 
 
 		 221 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  30.77 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  30.14 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  28.96 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  30.14 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  28.96 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  30.73 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  28.9 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  37.27 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  32.34 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  29.86 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  30.88 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  32.77 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  34.15 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  26.85 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  27.15 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  28.03 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  29.95 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  25.68 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  26.85 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  30.33 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  29.49 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  30.99 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  30.28 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.11 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  31.91 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  28.97 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  29.03 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  26.26 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28.97 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  32.26 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  33.16 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  26.39 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>