186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3075 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 225 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  70.48 
 
 		 225 aa  301  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  33.62 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  35.68 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  32.16 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  27.35 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  30.09 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  28.32 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  30.74 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  30.6 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  29.87 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  28.44 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  30.3 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  28.19 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  31.84 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  28.77 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  27.68 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.57 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  31.17 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  31.17 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  31.17 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  30.64 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  28.63 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  31.17 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.3 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.11 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  28.7 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  29.2 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  27.4 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  30.43 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  29.65 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  29.36 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  29.87 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  27.4 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  29.15 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  29.87 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  29 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.83 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  30.74 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  27.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  31.39 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  31.06 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  27.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  27.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  27.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  28.76 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  26.94 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  26.94 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  28.32 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  28.69 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  26.24 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.82 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  29.35 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  28.07 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  28.63 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  29.61 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  28.44 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  29.52 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  27.23 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  28.75 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  27.23 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  28.12 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  29.87 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  29.87 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  28.07 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  27.23 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  27.88 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  28.15 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  26.11 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  25.11 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  30.13 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  34.87 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  28.32 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.67 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  41.49 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  27.68 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  28.39 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  27.23 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  28.45 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  26.25 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  27.71 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  28.45 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>