164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0232 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  45.41 
 
 
220 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  46.54 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  43.12 
 
 
220 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  42.2 
 
 
220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.94 
 
 
259 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  32.74 
 
 
254 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  31.02 
 
 
258 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  31.51 
 
 
222 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  30.56 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.95 
 
 
255 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  31.65 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  33.03 
 
 
258 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.94 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  33.19 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 
283 aa  94.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  33.03 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  29.19 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  31.16 
 
 
267 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.88 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.52 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.91 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 
259 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.11 
 
 
257 aa  88.2  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  29.36 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  34.26 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.91 
 
 
282 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  28.24 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  29.82 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  31.82 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.16 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  32.42 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  28.77 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  28.24 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.68 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  29.58 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  28.96 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  27.7 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  27.4 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.03 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  27.4 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  27.4 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  27.85 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  26.39 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  30.22 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  27.23 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  26.03 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  26.03 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.2 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  27.35 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  27.52 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  25.93 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  26.67 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  27.31 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  25.46 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  25.46 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  28.14 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  24.89 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  28.31 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  26.46 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  25.79 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  25.79 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  25.91 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  25.79 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  25.79 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  25.74 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  27.6 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  27.97 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  25.79 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.24 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  24.44 
 
 
319 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  24.54 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  26.27 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  25.34 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>