142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0849 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
230 aa  441  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  65.22 
 
 
250 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  62.88 
 
 
232 aa  286  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  56.52 
 
 
233 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  52.81 
 
 
263 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  55.46 
 
 
263 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  51.74 
 
 
274 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  54.02 
 
 
246 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  51.53 
 
 
268 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  53.04 
 
 
260 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  51.3 
 
 
254 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  50.66 
 
 
260 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  50.66 
 
 
279 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  50.88 
 
 
251 aa  214  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  48.03 
 
 
297 aa  210  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  48.03 
 
 
272 aa  209  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  50.88 
 
 
272 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  49.34 
 
 
295 aa  207  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  47.16 
 
 
288 aa  191  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  50.23 
 
 
269 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  47.6 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  44.93 
 
 
247 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  40.69 
 
 
372 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  39.3 
 
 
244 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  39.3 
 
 
244 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  30.6 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  29.87 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  31.6 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  32.19 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  30.8 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.49 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  28.51 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  30.3 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  28.26 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.68 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.62 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  32.37 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  30.41 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  31.6 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  28.83 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.91 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.31 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  33.05 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  29.57 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  26.09 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  29.95 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  27.83 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  28.45 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  29.52 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  26.97 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  32.19 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  29.27 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  23.66 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.96 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  26.05 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  30.22 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.51 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  25.99 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  29.93 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  29.93 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  29.93 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  28.51 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.01 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  21.74 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  27.78 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.88 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  27.19 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  27.37 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  28.05 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  26.63 
 
 
225 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
225 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  27.64 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  24.78 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  26.73 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  31.03 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  26.15 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  24.79 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>