100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1258 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  74.57 
 
 
250 aa  353  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  62.88 
 
 
230 aa  286  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  56.28 
 
 
263 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  55.17 
 
 
233 aa  252  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  56.77 
 
 
260 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  55.46 
 
 
268 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  55.46 
 
 
254 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  55.36 
 
 
246 aa  244  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  54.94 
 
 
260 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  56.33 
 
 
272 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  57.46 
 
 
263 aa  234  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  53.22 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  50.43 
 
 
251 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  49.14 
 
 
279 aa  225  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  50 
 
 
295 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  48.28 
 
 
297 aa  217  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  52.86 
 
 
269 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  45.02 
 
 
272 aa  203  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  51.97 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  45.69 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  46.98 
 
 
288 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  41.99 
 
 
372 aa  181  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  38.91 
 
 
244 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  38.91 
 
 
244 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  33.94 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  32.05 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  33.62 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.86 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.61 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.73 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  30.18 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  29.66 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.19 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  31.28 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.03 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  33.02 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.87 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  27.27 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  31.65 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  25.44 
 
 
319 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.13 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  28.33 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  31.14 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  31.14 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  29.3 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.27 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  25.88 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.26 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  31.2 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  31.88 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  27.31 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  28.07 
 
 
222 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  26.32 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  27.06 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  22.81 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  23.4 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.54 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  24.23 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  24.89 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  27.12 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  23.55 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  23.55 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  23.08 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  23.61 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  23.35 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  26.47 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  24.68 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  26.05 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  23.81 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  25.74 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  23.93 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  26.05 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  21.61 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  21.61 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  21.61 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  21.46 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  25.63 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  24.56 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  23.85 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  23.68 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  26.05 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  23.53 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  23.95 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>