89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2228 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 251 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  79.22 
 
 		 254 aa  362  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  62.66 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  64.5 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  64.32 
 
 		 263 aa  288  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  60.98 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  61.47 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  59.75 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  62.18 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  58.82 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  50.43 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  50.66 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  50 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  50.88 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  51.09 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  46.69 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  42.45 
 
 		 297 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  42.86 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  42.42 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  42.42 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  44.07 
 
 		 372 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  44.4 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  38.29 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  39.83 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  39.83 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  27.39 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  28.74 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  32.1 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  26.64 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  28.91 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.81 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.72 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  26.64 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  26.86 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  27.78 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.42 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  31.6 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  32.4 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.94 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  27.64 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.34 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.64 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  27.23 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  27.27 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.88 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  27.27 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  27.98 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  22.65 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  26.74 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  26.74 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.12 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.35 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  24.77 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  25.25 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  22.94 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  26.07 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  23.18 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  27.04 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  30 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  25.12 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  25.1 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  25.76 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  28.49 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  22.81 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  22.81 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  24.69 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  22.55 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  27.53 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  21.79 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  24.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  25.11 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  32.97 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  22.65 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  24.08 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  26.19 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  24.08 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  22.65 
 
 		 223 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>