117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0950 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  76.45 
 
 
268 aa  355  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  72.84 
 
 
274 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  73.66 
 
 
246 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  75.42 
 
 
260 aa  340  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  69.39 
 
 
254 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  73.25 
 
 
260 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  72.61 
 
 
272 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  71.25 
 
 
269 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  64.32 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  59.76 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  53.88 
 
 
250 aa  249  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  56.52 
 
 
233 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  57.46 
 
 
232 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  54.1 
 
 
263 aa  245  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  55.46 
 
 
230 aa  242  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  48.22 
 
 
279 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  46.38 
 
 
297 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  44.36 
 
 
295 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  43.7 
 
 
272 aa  203  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  41.61 
 
 
288 aa  191  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  46.78 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  44.54 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  41.67 
 
 
244 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  41.67 
 
 
244 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  29.53 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.62 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  31.68 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  33.61 
 
 
258 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  30.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  30.95 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.35 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  33.2 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  33.33 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  32.5 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  28.34 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  32.37 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  30.67 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  29.62 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  31.54 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  29.02 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  32.84 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  30.38 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  30.04 
 
 
220 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  32.13 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  29.61 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  32.41 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.99 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  24.26 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  26.86 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  26.07 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  25.75 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.3 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  24.14 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  29.38 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  27.5 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.42 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  28.19 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  25.35 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  30.13 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.46 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  25.88 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  29.61 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  25 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  31.21 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  26.72 
 
 
226 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  35.56 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  25.79 
 
 
221 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  25.27 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  25.27 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  29.26 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  25.09 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  24.46 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  31.18 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  29.93 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  25.32 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  25.9 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  24.79 
 
 
237 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  29.25 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  32.26 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  31.18 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  32.26 
 
 
229 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  28.28 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>