112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1270 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  91.59 
 
 		 226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  91.59 
 
 		 226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  86.73 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1320  phage shock protein A, PspA  86.73 
 
 		 226 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133998 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6130  phage shock protein A, PspA  86.73 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1949  phage shock protein A, PspA  86.73 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1973  phage shock protein A, PspA  86.73 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  0.0785415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1863  phage shock protein A, PspA  86.28 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00208754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1936  phage shock protein A, PspA  85.84 
 
 		 226 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2519  PspA/IM30 family protein  85.84 
 
 		 226 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.167742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2081  PspA/IM30 family protein  85.84 
 
 		 226 aa  345  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2413  PspA/IM30 family protein  85.84 
 
 		 226 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.685259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1498  PspA/IM30 family protein  85.4 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1998  PspA/IM30 family protein  85.4 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3312  PspA/IM30 family protein  85.4 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0293434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2371  PspA/IM30 family protein  85.4 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1270  PspA/IM30 family protein  85.4 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514415  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  27.9 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  28.32 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  29.36 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  27.68 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  28.96 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  27.48 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.61 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.59 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.06 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  29.39 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.19 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  24.48 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  29.39 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  25.68 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  25.78 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  28.27 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  28.05 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.13 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  25.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  27.63 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  26.16 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  25.33 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  27.19 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.34 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  26.67 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.07 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  26.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  27.9 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.06 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  30.43 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  30.14 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  24.79 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  23.46 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  23.87 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  23.35 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  25.17 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  27.9 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  23.77 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  27.47 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  29.2 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  28.28 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  28.33 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  25.44 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  26.5 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  27.14 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  26.07 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  22.67 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3175  phage shock protein A, PspA  28.03 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  25 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  22.67 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  25.82 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  23.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  21.62 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  21.97 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  21.62 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  21.62 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  22.81 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  28.1 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  22.69 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  23.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  23.53 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  25.97 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.08 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  21.33 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>