45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0793 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  42.41 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  34.11 
 
 		 258 aa  128  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  33.85 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  33.46 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  34.78 
 
 		 259 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  32.14 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.75 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  31.5 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  32.21 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  31.91 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  30.59 
 
 		 255 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  32.3 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.59 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  31.91 
 
 		 258 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  35.58 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  32.46 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  30.45 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  30.16 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  27.54 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  30.16 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  25.23 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  24.71 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  27.91 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  27.65 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.6 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  26.59 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  22.29 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  26.92 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  24.55 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  25.24 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  26.01 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  25.6 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  22.02 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  23.2 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  27.23 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  23.03 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  23.03 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  23.03 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.7 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  22.8 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  22.75 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  26.98 
 
 		 260 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>