91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2065 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 278 aa  530  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2336  hypothetical protein  56.31 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354341  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4425  hypothetical protein  54.37 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0914  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  55.17 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  63.83 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  62.79 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  36.89 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  40 
 
 		 501 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  35.58 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.63 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2775  Peptidoglycan-binding LysM  57.45 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  39.08 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  24.75 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  45.65 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3071  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 		 203 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  28.1 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 371 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  28.42 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  27.19 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1186  Slt family transglycosylase  42.31 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  32.14 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1785  cell wall-associated hydrolase  33.86 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.66 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.48 
 
 		 1001 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 		 445 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  29.17 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  45.65 
 
 		 499 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  42.68 
 
 		 390 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 1021 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 596 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 590 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  46.81 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  45.65 
 
 		 430 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  29.82 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.12 
 
 		 470 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  32.5 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 661 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  41.94 
 
 		 788 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  31.18 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  41.18 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.9 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 620 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  37.29 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 519 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.18 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  42 
 
 		 538 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  25 
 
 		 602 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  36.36 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.18 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  42 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  38.3 
 
 		 465 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  39.62 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  36.62 
 
 		 557 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0797  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  31.58 
 
 		 553 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 733 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82669  Nucleoskeletal protein  28.24 
 
 		 1019 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.744572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  32.73 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 		 414 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  38.33 
 
 		 483 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  36.84 
 
 		 474 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  39.62 
 
 		 473 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  38.33 
 
 		 483 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  38.33 
 
 		 483 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  36.84 
 
 		 474 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 362 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02472  murein hydrolase D  50 
 
 		 387 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  37.5 
 
 		 362 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  37.25 
 
 		 246 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  38.33 
 
 		 483 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  39.22 
 
 		 231 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>