22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3071 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3071  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 315 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2775  Peptidoglycan-binding LysM  77.04 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4452  peptidoglycan-binding LysM  61.9 
 
 		 106 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000899007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 466 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  31.48 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  36.63 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  40.22 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 		 390 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.59 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  49.18 
 
 		 444 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  42.31 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 705 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  41.43 
 
 		 128 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  46.38 
 
 		 390 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.45 
 
 		 590 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 587 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>