32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2775 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2775  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 336 aa  631  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3071  peptidoglycan-binding LysM  79.59 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4452  peptidoglycan-binding LysM  59.05 
 
 		 106 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000899007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 175 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  57.78 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  53.49 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  38.2 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 440 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  42.86 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  28.74 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 466 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 203 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  32.92 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  39.18 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.98 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  35.51 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  34.82 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  33.93 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02472  murein hydrolase D  41.12 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  40.79 
 
 		 501 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 445 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  34.34 
 
 		 509 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  41.38 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0841  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  33.8 
 
 		 499 aa  43.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  34.34 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  39.39 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 590 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  44.87 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01443  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1309 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.968118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>