More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1372 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1372  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521856  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  61.63 
 
 		 718 aa  204  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  59.78 
 
 		 715 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  39.66 
 
 		 737 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.5 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 821 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 817 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 702 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  40.91 
 
 		 812 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 753 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 		 698 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 820 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  29.3 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  37.01 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 		 825 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 820 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 710 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  32.75 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 823 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 823 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 823 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 730 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  30.95 
 
 		 693 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 831 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  30.19 
 
 		 807 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 820 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  39.83 
 
 		 693 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 726 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 811 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 812 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  33.61 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 703 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 757 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  37.27 
 
 		 825 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  38.39 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 824 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 810 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 723 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 		 806 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 792 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 690 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 727 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 715 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 771 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.75 
 
 		 689 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 706 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 770 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 771 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 789 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 767 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 743 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 709 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  38.4 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 797 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 		 751 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 710 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 719 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 743 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  37.68 
 
 		 743 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 743 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  31.52 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 699 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  38.26 
 
 		 697 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 785 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  38.85 
 
 		 743 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 743 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 742 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 717 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  36.51 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 837 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 701 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 717 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 705 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 706 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 		 724 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 727 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 828 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 697 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 743 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 740 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  40.18 
 
 		 813 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>