More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0155 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  99.76 
 
 
413 aa  771    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  100 
 
 
413 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  96.37 
 
 
413 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  69.5 
 
 
419 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  44.35 
 
 
355 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  47.23 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  48.77 
 
 
353 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  44.86 
 
 
353 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  44.37 
 
 
353 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
1276 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  34.5 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.88 
 
 
1694 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
4079 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
505 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 
810 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
1094 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
4489 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
3035 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
878 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.62 
 
 
739 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.68 
 
 
1007 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.27 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
927 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 
740 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
1192 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
955 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.2 
 
 
1138 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.67 
 
 
560 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
523 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
836 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  28.43 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
935 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 
576 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.63 
 
 
573 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.36 
 
 
676 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  31.73 
 
 
615 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
565 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
465 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.39 
 
 
648 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.45 
 
 
745 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.84 
 
 
623 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
3560 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.64 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
254 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  27.81 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.27 
 
 
739 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 
564 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
784 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 
1979 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  20.54 
 
 
554 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.59 
 
 
641 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.33 
 
 
937 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 
314 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
605 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.67 
 
 
603 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
711 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.05 
 
 
837 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
685 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  24.75 
 
 
191 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 
222 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  38 
 
 
112 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  25.76 
 
 
571 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.35 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
562 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
249 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  33.58 
 
 
145 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.74 
 
 
542 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
909 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
662 aa  56.6  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 
196 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.1 
 
 
1676 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  32.84 
 
 
145 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.02 
 
 
880 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.4 
 
 
581 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
574 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
681 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.12 
 
 
707 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.79 
 
 
252 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 
240 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
818 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
602 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>