139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5659 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  100 
 
 
468 aa  906    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  43.13 
 
 
419 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  46.57 
 
 
413 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  45.97 
 
 
413 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.97 
 
 
413 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  43.96 
 
 
353 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  43.84 
 
 
353 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  38.44 
 
 
355 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  43 
 
 
353 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  34.04 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  31.4 
 
 
122 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  31.36 
 
 
112 aa  60.1  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 
1694 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
4489 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  35.54 
 
 
122 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 
639 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 
636 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  41.82 
 
 
123 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
3035 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
465 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 
612 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
637 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  31.71 
 
 
121 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
927 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
635 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
635 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.34 
 
 
1676 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  35.66 
 
 
118 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
611 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  40.86 
 
 
626 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  40.86 
 
 
626 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  40.86 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  40.86 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
523 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  28.91 
 
 
131 aa  53.5  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  34.4 
 
 
131 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  28.93 
 
 
123 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
438 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  28.46 
 
 
113 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  32.14 
 
 
133 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  28.93 
 
 
115 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  31.78 
 
 
132 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
620 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.21 
 
 
620 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
4079 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
3560 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.51 
 
 
810 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  32.74 
 
 
117 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 
626 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
681 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
362 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 
836 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
608 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
685 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
909 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.37 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
740 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
878 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
1406 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  26.61 
 
 
116 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
1737 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  33.06 
 
 
121 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 
615 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.26 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
605 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  29.85 
 
 
154 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  30.58 
 
 
116 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
654 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  32.56 
 
 
165 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.29 
 
 
730 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
649 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
649 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
249 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  23.9 
 
 
623 aa  47.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
713 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
249 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
509 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
592 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 
1979 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 
252 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>