88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0544 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  100 
 
 
116 aa  231  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  69.03 
 
 
113 aa  150  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  73.28 
 
 
116 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2853  hypothetical protein  72.57 
 
 
114 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  66.37 
 
 
116 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  61.21 
 
 
116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  62.83 
 
 
116 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  58.97 
 
 
118 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  59.29 
 
 
116 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  59.29 
 
 
116 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  59.29 
 
 
116 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  59.29 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  62.62 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  68.1 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  56.78 
 
 
142 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34000  hypothetical protein  61.34 
 
 
120 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113153  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  59.32 
 
 
142 aa  127  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3505  protein of unknown function DUF1025  61.67 
 
 
121 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3083  protein of unknown function DUF1025  63.79 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  57.52 
 
 
116 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  54.95 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  53.98 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  57.14 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  61.95 
 
 
116 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2901  protein of unknown function DUF1025  62.07 
 
 
117 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.889781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  56.14 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  52.73 
 
 
112 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  64.15 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5033  hypothetical protein  64.91 
 
 
114 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  48.21 
 
 
115 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  52.99 
 
 
122 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  48.72 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  39.34 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  44.17 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  87  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  38.93 
 
 
132 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  42.86 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  34.96 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  37.5 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  33.91 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  32.8 
 
 
355 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  31.2 
 
 
353 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  30.4 
 
 
353 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
353 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  37.74 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  35.09 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  30.51 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  33.04 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  33.04 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  33.61 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  33.05 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4699  protein of unknown function DUF1025  34.34 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  35.14 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  31.93 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  32.46 
 
 
137 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  31.09 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  31.58 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  43.08 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  29.82 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  31.3 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  30.58 
 
 
468 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  35.21 
 
 
413 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 
413 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  35.21 
 
 
413 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  30.09 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  28.69 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  31.93 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  44.62 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  44.62 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  39.06 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  41.54 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  35.94 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  35.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  38.96 
 
 
133 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
419 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  34.69 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  31.13 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  33 
 
 
119 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>