90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0308 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  93.39 
 
 		 121 aa  226  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  65.29 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  52.1 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  51.26 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  51.26 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  56.03 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  45.38 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  45.54 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  49.19 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  43.65 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  45.53 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  48.33 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  44.17 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  45.83 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  44.54 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  42.74 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  44.54 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  45.38 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  43.7 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  46.15 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  43.7 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  43.7 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  41.53 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2853  hypothetical protein  45.3 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  40.34 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  42.02 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3505  protein of unknown function DUF1025  45.83 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34000  hypothetical protein  44.17 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113153  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  41.03 
 
 		 380 aa  76.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  37.98 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5033  hypothetical protein  44.54 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  42.02 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  47.06 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  41.23 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3083  protein of unknown function DUF1025  45.76 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  34.45 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  33.87 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  34.45 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  33.93 
 
 		 355 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2901  protein of unknown function DUF1025  41.67 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.889781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  31.5 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  39.13 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  31.97 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  34.69 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  39.5 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  31.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  31.86 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  30.97 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  31.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  30.25 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  29.06 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  31.25 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  33.33 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  29.06 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  28.81 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4699  protein of unknown function DUF1025  35.59 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  31.86 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  27.35 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  26.72 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  27.91 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  27.97 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  28.44 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  28.1 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  28.36 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  29.82 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  25.64 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  25.62 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  24.79 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  25.69 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  33.98 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  23.81 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  24.51 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  23.14 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  23.53 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 419 aa  40.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  38.24 
 
 		 413 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 		 413 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  38.24 
 
 		 413 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>