37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1500 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  41.28 
 
 		 355 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  41.88 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  41.88 
 
 		 353 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  41.03 
 
 		 353 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 		 419 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  41.82 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.58 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  39.58 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  39.58 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  29.17 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  31.43 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  30.17 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  29.17 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  29.31 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  34.23 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  28.69 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  29.27 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  27.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  30.48 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  38.36 
 
 		 115 aa  43.9  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  33.03 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  33.98 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  30.63 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  34.25 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  29.52 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>