88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0235 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  100 
 
 
137 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  81.68 
 
 
133 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  78.63 
 
 
133 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  74.05 
 
 
133 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  69.47 
 
 
133 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  69.92 
 
 
133 aa  196  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  75.83 
 
 
120 aa  193  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  63.16 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  64.12 
 
 
141 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  61.94 
 
 
146 aa  167  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  60.94 
 
 
138 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  63.91 
 
 
140 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  61.94 
 
 
140 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  54.96 
 
 
148 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  54.96 
 
 
140 aa  157  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  54.96 
 
 
140 aa  156  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  63.16 
 
 
146 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  53.79 
 
 
147 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  62.41 
 
 
146 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  57.69 
 
 
135 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  56.06 
 
 
154 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  51.49 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  52.38 
 
 
145 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  52.38 
 
 
145 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  55.47 
 
 
165 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  50.79 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  46.51 
 
 
132 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  44.53 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  43.2 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  46.15 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  41.27 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  41.27 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  43.09 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  34.51 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  35.04 
 
 
380 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  33.03 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  29.57 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  29.06 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  29.06 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  37.14 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  29.06 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  27.68 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  35.24 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  29.77 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  38.24 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  40.3 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  37.68 
 
 
116 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  32.46 
 
 
116 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  29.57 
 
 
355 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  30.51 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
419 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  28.18 
 
 
116 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  28.81 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
353 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  33.03 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  34.29 
 
 
353 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  29.73 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  35.82 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  33.01 
 
 
353 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  34.78 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  29.03 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  30.97 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  29.29 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  29.57 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  36.51 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2901  protein of unknown function DUF1025  30.77 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.889781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3083  protein of unknown function DUF1025  30.43 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2853  hypothetical protein  27.68 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3505  protein of unknown function DUF1025  32 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34000  hypothetical protein  28.18 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113153  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  30.19 
 
 
468 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  29.21 
 
 
413 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 
413 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5033  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  29.21 
 
 
413 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>