91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4376 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  80 
 
 		 144 aa  243  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  85.19 
 
 		 145 aa  243  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  84.44 
 
 		 145 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  70.71 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  67.38 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  68.57 
 
 		 148 aa  207  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  61.36 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  59.85 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  55.3 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  55.3 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  58.91 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  53.79 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  55.91 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  54.33 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  54.2 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  53.44 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  57.14 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  56.49 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  52.63 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  54.96 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  46.62 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  45.52 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  48.8 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  43.38 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  42.28 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  42.28 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  37.21 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  40.46 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  42.28 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  35.43 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  35.77 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  38.33 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  36.28 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  36.28 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  32.5 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  35.4 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  34.78 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  34.17 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  32.73 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  31.03 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  32.17 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  33.94 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  32.48 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  35.34 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  29.06 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  31.3 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  32.8 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  35.45 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  32.74 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  30.65 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  35.09 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  31.36 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 353 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  35.9 
 
 		 380 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  29.91 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  34.51 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  31.19 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  29.91 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5033  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  25.98 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3505  protein of unknown function DUF1025  30.17 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  37.68 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  30 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  31.53 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  33.93 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34000  hypothetical protein  32.46 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113153  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2853  hypothetical protein  31.3 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420761  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  30.63 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3083  protein of unknown function DUF1025  31.58 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  29.17 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2901  protein of unknown function DUF1025  32.17 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.889781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  27.68 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  31.25 
 
 		 413 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 413 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  34.07 
 
 		 413 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  27.73 
 
 		 149 aa  40.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  26.09 
 
 		 468 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  26.89 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.198874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>